Добовление книги например в одну из популярных программ как iBooks
А) Подключаем iДевайс к компьютеру, запускаем iTunes, в верхнем меню выбираем файл\добавить файл в медиатеку (можно просто Ctrl+O) и указываем путь к книге.

Б)

1. Выбираем устройства

2. Вкладка книги

3. Ставим галочки на книги которые Вы хотите видеть на iДевайсе и синхронизируем

Добавление книги если программа поддерживает проводник Windows (только на прошивках не ниже iOS 4.0), например GoodReader

1. Выбераем устройство

2. Вкладка программы

3. В самом низу выбираем программу

4. Нажимаем кнопку "Добавить" и указываем путь где лежит книга.